さらに、セキュリティ分野のプロトコルとして「IPsec（Security Architecture for Internet Protocol）」や「SSL/TLS」が深く関連します。IPsecを用いてネットワーク層で通信全体を暗号化する「IPsec-VPN」は、拠点間を常時接続する用途によく使われます。これに対し、Webブラウザの標準機能であるSSL/TLSを利用する「SSL-VPN」は、外出先のPCやスマートフォンなどのWebブラウザから手軽に社内システムへリモートアクセスする用途に適しています。試験では、これらのプロトコルがVPNのどの場面（ネットワーク層か、あるいはアプリケーション層か）で利用されるか、それぞれの接続形態とセットで問われやすいため注意が必要です。

VPNを支える暗号化および認証通信プロトコルである「IPsec」、Webサイトとの安全な通信を実現しVPNの接続手段としても用いられる「SSL/TLS」、暗号化やカプセル化を行わずに拠点間を物理的に直結する「専用線」などがあります。