• 制御用コネクション（ポート番号21）：ログイン用のIDやパスワード、ファイルの取得命令（GETなど）、フォルダ移動などの「コマンド」をやり取りする専用の通信路です。終始接続が維持されます。
• データ転送用コネクション（ポート番号20）：実際のファイルデータや、ファイル一覧のリストなどを転送する瞬間にのみ確立され、転送が終わると即座に切断される通信路です。

また、データ転送コネクションを確立する際の接続方向により、「アクティブモード」と「パッシブモード」という2つの動作モードがあります。初期のアクティブモードでは、サーバー側からクライアントに向けて接続を開始するため、クライアント側のファイアウォールやルータ（NAT）によって接続が遮断されてしまうという問題がありました。これを解決するため、データ接続もクライアント側からサーバーに向けて開始するように工夫されたのが「パッシブモード（PASV）」であり、現在多くの環境で標準的に利用されています。