また、VPNには大きく分けて「インターネットVPN」と「IP-VPN」の2種類が存在します。インターネットVPNは、一般的なインターネット回線を利用するためコストを非常に低く抑えられるメリットがありますが、通信速度や品質が他のインターネット利用者のトラフィックに左右されるという弱点があります。一方、IP-VPNは、通信事業者が独自に保有・管理している閉域網（プライベートなIPネットワーク）を利用します。インターネットとは物理的・論理的に隔離されたクローズドなネットワークを通るため、きわめてセキュリティが高く、通信帯域や速度も保証されていることが多いですが、インターネットVPNに比べて導入・運用のコストが高額になります。
基本情報技術者試験においては、VPNの基本的な仕組みであるトンネリングやカプセル化、暗号化の概念を理解しているかが問われます。また、インターネットVPNとIP-VPNの性質の違いについての比較問題も頻出です。それぞれのコスト面、セキュリティの高さ、通信品質の安定性を整理して覚えておく必要があります。
さらに、セキュリティ分野のプロトコルとして「IPsec（Security Architecture for Internet Protocol）」や「SSL/TLS」が深く関連します。IPsecを用いてネットワーク層で通信全体を暗号化する「IPsec-VPN」は、拠点間を常時接続する用途によく使われます。これに対し、Webブラウザの標準機能であるSSL/TLSを利用する「SSL-VPN」は、外出先のPCやスマートフォンなどのWebブラウザから手軽に社内システムへリモートアクセスする用途に適しています。試験では、これらのプロトコルがVPNのどの場面（ネットワーク層か、あるいはアプリケーション層か）で利用されるか、それぞれの接続形態とセットで問われやすいため注意が必要です。
VPNを支える暗号化および認証通信プロトコルである「IPsec」、Webサイトとの安全な通信を実現しVPNの接続手段としても用いられる「SSL/TLS」、暗号化やカプセル化を行わずに拠点間を物理的に直結する「専用線」などがあります。